|
| |
|
|  |
https://doi.org/10.15407/ukrbotj79.01.027
Бойко С.М.
Розробка мікросателітних маркерів для Schizophyllum commune (Agaricales, Basidiomycota) на підставі аналізу його геному
Резюме Прості повторювані послідовності ДНК (SSR) на сьогодні є найпопулярнішим джерелом генетичних маркерів, що використовуються в популяційній генетиці, філогенетиці та генетичному картографуванні. У роботі проведено аналіз геному гриба Schizophyllum commune для пошуку послідовностей SSR та синтезу ДНК-маркерів. Встановлено велику кількість нуклеотидних повторів, збагачених на G та C. Зафіксовано 336 мононуклеотидних мотивів з кількістю повторів більше десяти. Ідентифіковано 2020 нуклеотидних повторів, з яких 97,4% складають ди- (68,2%) та тринуклеотиди (29,2%). Загальна кількість унікальних SSR локусів, до яких було розроблено парні праймери, склала 1920. Наведено послідовності ПЛР-праймерів для унікальних SSR локусів геному S. commune. Серед синтезованих двадцяти двох SSR маркерів до геному S. commune на зразках свіжовиділеної ДНК амплікони утворювали 64%.
|
